Meist sind Drittmittelstellen zeitlich befristet, da die Mittel hierfür oft Zweckgebunden und auch befristet eingeworben werden. Weiterhin kann es sein, dass der Bewerber / Angestellte entsprechend der Zweckbindung besondere Fähigkeiten mitbringen muss (z. B. Erfahrung mit bestimmten Methoden). Deshalb würde ich mich nach eben diesen Merkmalen genau erkundigen. Ansonsten sollte es keinen großen Unterschied machen, ob Deine Stelle aus Drittmitteln oder Kassenmitteln bezahlt wird.