Ich würde jeweils neue Logbücher ausfüllen lassen. Am Ende müssen die Zahlen und Formulierungen der ÄK passen, in der du die Prüfung machst. Wenn du alles im ersten Logbuch hast, dann kann es sein, dass was für die letzte ÄK nicht passt. Mit einem neuen Logbuch kann der letzte Chef noch anpassen und das bescheinigen was bei den andere Logbüchern evtl. gar nicht enthalten ist.
Zur zweiten Frage: ÄK fragen, die haben manchmal komische Ansichten. Die Antwort tunlichst schriftlich geben lassen. Wenn schon klar ist, dass du in einer anderen ÄK abschließt dann die noch zusätzlich fragen.
Niedersachsen hatte z.B. für die Chirurgie eine Sonderregelung (zumindest bis zur Änderung der Weiterbildungsordnung).